Как разместить индикатор выполнения какой-либо задачи в панели состояния? Как сделать такой как, например, при сравнении-объединении конфигураций в конфигураторе показывается?

Никак. Нету туды доступа. Можно процентами отображать. Или палочками [|||||||| ] но это изврат.

Я люблю на время выполнения какого либо процесса делать индикатор на форме видимым, но при завершении снова его прятать....

Для того,чтобы это сделать, необходимо отчет написать на СКД, и при выводе использовать инструкции этой вот крутизны - ПроцессорВыводаРезультатаКомпоновкиДанныхВТабличныйДокумент. Посмотри, как формируется, например, расчетный листок (есессно, если конфа обновленная и он построен на СКД).