8.х ОБМЕН Перенос контрагентов через конвертацию данных

убрать крыж с кода. через помощник синхронизации или вручную добавить реквизит ИННН. Установить флаг

добавить ПКС ИНН и КПП в ПКО контрагенты, поставить галки поиска на них, с кода убрать, в свойствак самого ПКО поставить галку "Продолжать поиск..."

если хотите, чтобы контрагенты переносились вместе со структурой групп, то также галку поиска поставить на Наименование и ЭтоГруппа и написать свой обработчик поиска в ПКО

если хотите, чтобы новые контрагенты переносились нормально, то добавляйте ПКС и для остальных свойств контрагента

сейчас у вас контрагенты не ищутся ни по чему, кроме уникального идентификатора

1. у этих дублей инн одинаковый?
2. инн не является достаточным идентификатором контрагента. инн+кпп - уже да
3. если хотите переносить структуру групп - нужен поиск еще и по наименованию (и соответственно свой алгоритм поиска), в вашем случае все группы сольются в одну, поскольку у групп нет инн, а свойство ЭтоГруппа у всех Истина.