8.х БП По каким причинам могут не попадать расходы в книгу доходов и расходов

Одного документа "Списание с р/с" мало.
Так же, как и одного документа "Передача материалов в эксплуатацию". Необходимо выполнение ВСЕХ условий, отмеченных в учетной политике.
Там для товаров свои условия, для материалов - свои.

Посмотрите, какие галки стоят для группы "Материальные расходы".
Вообще, по законодательству достаточно двух первых галок (которые, кстати, недоступны для редактирования).
Т.е. если у Вас установлены только эти две галки, то чтобы материалы попали в расход (в 7 графу), надо:
1) Оприходовать эти материалы (документ "Пступление ТиУ") на 10 сч.
2) Оплатить эти материалы поставщику (документ "Списание с р/с").
Если установлена третья галка ("Передача материалов в производство"), тогда
3) Списать эти материалы (документ "Требование-накладная" или "Передача материалов в эксплуатацию" или др.)

Вот...пока все условия не выполнятся расход не появится в 7 графе.

Если не попали, значит материалы еще не оприходованы. Или не списаны.

Кстати, при разных видах операции программа ведет себя по-разному. При некоторых операциях доступна кнопка "КУДиР", где можно вручную отредактировать принятие (или непринятие расхода).

Если не попадают, значит на тот момент материал еще не оплачен.

Еще раз - необходимо выполнение ВСЕХ условий, отмеченных в учетной политике.

Потому что одной оплаты мало.
Так, давайте разберем какой-нибудь конкретный случай.
Вот есть у Вас документ "Списание с р/с" - замечательно. Полдела сделано.
Вопрос - за что была произведена эта оплата???

Да в 1с8, вроде, все точно так же.
Не попадает, значит не все условия выполнены.
Может, товар не из той партии списался, которую оплатили. Или еще что-нибудь...
Надо смотреть движения по регистрам и разбираться в каждом конкретном случае.

Думаю, надо смотреть начисление налогов. Как там отразилось.
Тут я немного не в теме (в части з/п и зарплатных налогов).
Но скорее всего, дело в начислениях.
Посмотрите, какие движения сформировались при начислении з/п и налогов.