8.х Проблема с обменом УТ <--> БП

Добрый день! Пожалуйста, помогите кто чем может
Стоит Управление Торговлей (10.3.11.4) и Бухгалтерия предприятие (1.6.24.7)
В общем беда такая: приходили настраивали обмен разные люди, в течении года, всегда по разному что-то делали, уходили и т.д. то префиксы поменяют, то еще что-нибудь. В общем обмен так работал, что у бухгалтера волосы дыбом стояли когда прибыли надо было уплатить ~2 млн, ну это все предисловие. Дай думаю разберусь.
Во-первых. начал смотреть по обмену что да как. Сделал "поиск совпадающих по полям синхронизации объектов синхронизации", на что мне этот поиск выдал, огромное количество документов у которых был одинаковый "Номер документа" (например счет-фактура от 14.03.10 с номером ВС0000143 и счет-фактура от 26.05.10 с таким же номером ВС0000143). И так во многих документов куча таких пар.
В общем, что дальше, посмотрел потом видно кто-то из спецов поставил префиксы, соответственно в УТ стало теперь УТВС... а в БП - БПВС......
Посовещавшись с бухгалтером. Решили мы сделать так:
1. очистить полностью бухгалтерию от всех документов
2. переименовать все префиксы которые есть в УТ (т.е. там были ВС, УТВС, БПВС) все в УТВС
3. сделать обмен с БП, а бухгалтерские документы добить в ручную.
Начал делать обмен, все почистил, перенумеровал все, что бы дублирующих номеров не было. выполнил обмен справочниками, выполнил обмен документами. Так вот возникли проблемы при проведени документов в БП. Например, документ "Поступление товаров и услуг", если были какие-то услуги, не проставляются счет затрат БУ/НУ.
Кто каким советом может помочь, буду очень признателен.

так же еще в платежных поручениях исходящее, у некоторых контрагентов не проставляются счета.

блин... в чем вопрос то?

почему так происходит и что сделать что бы все нормально обменивалось, а не так: обмен прошел 30 документов стало не проведенными, пропали счета, за двоились номера документов.